СТРУКТУРНЫЕ И КОНФОРМАЦИОННЫЕ ОСОБЕННОСТИ ФРАГМЕНТОВ МОЛЕКУЛЫ ГИЛАМБАТИНА
Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
Молекула гиламбатина по своим структурным особенностям и функциональным действиям относится к тахикининовым нейропептидам. Расчет стабильных конформационных состояний фрагментов молекулы позволил определить локальные элементы вторичной структуры и энергетически предпочтительную взаимную ориентацию остатков в стабильных конформационных состояниях фрагментов. В полученных стабильных конформационных состояниях фрагментов были уточнены и энергетически оценены взаимовыгодные взаимодействия боковых цепей остатков и водородные связи. Расчет показал, что С-концевой пентапептид молекулы энергетически предпочтительно формирует альфа-спиральную конформацию, стабилизированную образованием водородных связей между атомами концевых групп. На основе рассчитанных значений двугранных углов были построены визуальные модели энергетически предпочтительных конформационных состояний исследуемых участков молекулы гиламбатина.

Ключевые слова:
гиламбатин, тахикинин, фрагмент, конформация, метод молекулярной механики
Текст
Текст произведения (PDF): Читать Скачать
Список литературы

1. Güllner H.G., Harris V., Yajima H., Unger R.H., Hylambatin, a structurally unique tachykinin: effects on insulin and glucagon secretion. Arch Int Pharmacodyn Ther., 1984, vol. 272, no. 2, pp. 304-309.

2. Inoue A., Fukuyasu T., Nakata Y., Yajima H., Nomizu M., Inagaki Y. , Asano K., Segawa T. Structure-activity relationship of hylambatin and its fragments as studied in the guinea-pig ileum. Journal of Pharmacy and Pharmacology, 1988, vol. 40, iss. 1, pp. 72-73.

3. Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godjaev N.M, The program for semiempirical calculation of conformations of the molecular complexes J. Struct. Khim., 1983, vol. 24, pp. 147-148.

4. Agaeva G.A., Agaeva U.T.,Godjaev N.M, The spatial organization of human hemokinin-1 and mouse/rat hemokinin-1 molecules. Biophysics, 2015, vol. 60, pp. 365-377.


Войти или Создать
* Забыли пароль?