Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
В работе, используя метод моделирования эксперимента in silico, производили докинг рецептора и его лигандов с целью получения данных необходимых для исследования возможности применения методов машинного обучения и жесткого, межмолекулярного докинга для предсказания потенциальных лиганд для различных рецепторов. Был выбран белок TRPM8, являющийся представителем суперсемейства TRP белков и его классический агонист — ментол в качестве лиганда. Известно, что ментол способен соединяться с тирозином 745 цепи B. Для осуществление всех манипуляций нами был использован софт Autodock и специальный набор графических инструментов, предназначенный для работы с моделями химических веществ in silico. В результате всех манипуляций были получены конформации ментола, способные соединяться с активным центром рецептора TRPM8.

Ключевые слова:
белок TRPM8, биоинформатика, молекулярный докинг
Список литературы

1. http://mgltools.scripps.edu/

2. http://autodock.scripps.edu/

3. https://www.rcsb.org/

4. https://www.rcsb.org/structure/6O6A

5. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/1254

6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19886999/

7. https://pytorch.org

8. Estrada T. et.al., “Graphic Encoding of Macromolecules for Efficient High-Throughput Analysis”. https://www.researchgate.net/publication/327215386_Graphic_Encoding_of_Macromolecules_for_Efficient_High-Throughput_Analysis?enrichId=rgreq-5906aa511772b9138e942ed98f2a4faf-XXX&enrichSource=Y292ZXJQYWdlOzMyNzIxNTM4NjtBUzo2NjU0OTkwNzU2MTY3NzBAMTUzNTY3ODc1MjUwNA==&el=1_x_2&_esc=publicationCoverPdf

Войти или Создать
* Забыли пароль?